Cuando los científicos entendieron la importancia de los microbios, comenzaron a diseñar técnicas para estudiarlos en el laboratorio. Utilizaron microscopía para estudiar sus formas físicas y técnicas de cultivo para clasificarlos.

Estas técnicas tradicionales nos han enseñado mucho y todavía se utilizan hoy en día, pero proporcionan una visión muy limitada del mundo microbiano. Recientemente, gracias a los avances de la secuenciación de ADN de alto rendimiento, los microbiólogos han dado un gran paso: ¡la metagenómica¹!

Hoy en día, las técnicas de cultivo y la metagenómica son complementarias. Qué caracteriza a las técnicas de metagenómica:

• Permiten a los científicos detectar especies de bacterias raras y las que no se pueden cultivar
• Permiten el análisis de una gran cantidad de muestras microbianas al mismo tiempo
• Nos dan una imagen instantánea de la diversidad de la población dentro de una muestra.

Estas técnicas requieren una experiencia muy específica en bioestadística e importantes recursos bioinformáticos para traducir los millones de secuencias de ADN que componen una población microbiana. También se basan en una base de datos específica de secuencias de bacterias conocidas, aunque aún hay una gran proporción que se desconocen. La rápida y sustancial reducción de costos en la secuenciación de nueva generación ha acelerado dramáticamente el desarrollo de la metagenómica basada en la secuenciación.

¹Metagenomics applies a suite of genomic technologies and bioinformatics tools to directly access the genetic content of entire communities of microorganisms. (Thomas et al., 2012)Thomas, T., Gilbert, J., & Meyer, F. (2012). Metagenomics – a guide from sampling to data analysis. Microbial informatics and experimentation, 2(1), 3. https://doi.org/10.1186/2042-5783-2-3