Desde 1993 el FEGA es el encargado de coordinar los controles previstos en el Sistema Integrado de Gestión y Control. Los controles de declaraciones y solicitudes de ayuda pueden hacerse de la denominada “forma clásica” que consiste en visitar directamente los terrenos en los que están los cultivos. La segunda forma es utilizar tecnologías basadas en las diversas imágenes multiespectrales enviadas por distintos satélites (Ikonos, Quickbird) a lo largo del período vegetativo de los cultivos. (teledetección).

La información obtenida por la teledetección se completa con visitas a campo. Ambas actividades pretenden contrastar la realidad del terreno con los datos declarados por los beneficiarios de las ayudas. Al mismo tiempo, y dado que las solicitudes se cumplimentan teniendo como base las referencias SIGPAC de las parcelas cultivadas, los controles asistidos por teledetección son un buen test de fiabilidad para el Sistema de Identificación de Parcelas Agrarias de la PAC en España.

Durante los primeros años, estos trabajos se financiaban con la aportación de la Comisión Europea, pero, a partir de 1999, el FEGA acordó con las Comunidades Autónomas participantes y destinatarias de los trabajos, el abono de un importe a tanto alzado por cada zona de control, mediante la formalización de los oportunos Convenios de Colaboración.

En este año 2008, las Comunidades Autónomas que han decidido suscribir los citados Convenios con el FEGA han sido: Andalucía, Aragón, Castilla y León, Castilla- La Mancha, Cataluña, Extremadura, Madrid, Murcia, La Rioja, País Vasco y Comunidad Valenciana, con un total de 21 zonas seleccionadas que suman una superficie útil de control de 1.928.198 hectáreas, pertenecientes a 611 municipios. Los expedientes analizados se elevan a 33.639 y la superficie declarada en los 410.920 recintos SIGPAC objeto de estudio ha alcanzado a 618.310 hectáreas. El montante económico total ha sido de 5, 58 millones de euros, de los que 2, 71 millones son aportados por el FEGA y el resto por las 11 Comunidades Autónomas participantes.